第一大不同：飞船有效载荷增加，火箭的推力将加大
与“神六”相比，“神七”飞船的有效载荷将会有所增加。“神七”会上3名航天员，还要携带舱外航天服和7天太空生活所需的物品，所以上去的时候要携带 300公斤的东西，回来的时候可以带100公斤的东西。飞船的重量比起“神六”来说要增加很多。“光舱外航天服的地面重量就达125公斤。”焦维新说。
另外，“神七”的外观与“神六”有所不同，由于“神七”会上3名航天员，在天上待7天。虽然‘神六’设计上可以能够搭载3个人，但是“神七” 的3名航天员要完成各项任务，飞船的容量肯定将有所增加。这就要求现有的运载火箭的推力满足“神七”要求。
第二大不同：“神七”轨道舱里将新添一个“夹层 ”
“神七”在轨道舱的设计上与“神六”相比有一些不同。“神七”航天员将进入太空，因此“神七”轨道舱须设计一个 “夹层 ”——“气闸舱”。焦维新教授解释说，航天员在出舱前先要“减压”，航天员从太空返回进入航天器后先要“升压”，其原理类似潜水员进出正在深海中的潜艇。 因此，航天器上必须有一个设施具有“卸压”功能和恢复功能。气闸舱将由两道门组成：航天员穿好舱外航天服把第一道门关上，后把第二道门打开，这样便能够保 证原来的舱里的氧气和压力。而回来的时候也一样，航天员必须分别经过这两道门。
俄罗斯的飞船将此设施专门做成了一个舱，叫“气闸舱”；而美国的飞船也有类似设施，但他们没有把它专门做成一个 “舱”，美国的飞船是“两舱结构”，只有指令舱和仪器舱，进出太空的这一设施直接就安装在指令舱里。“气闸舱位于返回舱的上方，与轨道舱连接。航天员爬上 ‘夹层’后，就会通知下面的航天员将‘夹层’的门给严密地封闭上。”焦维新教授说，“飞行员换上太空行走的航天服后，放掉‘夹层’里的气体，打开舱门后， 航天员就可以到轨道外面，进行太空行走了。
第三大不同：“神七”轨道舱将不会在轨“驻守”
焦维新教授认为，和“神六”相比，“神七”飞船的一个显著不同在于飞船完成任务后，轨道舱将不会在轨“驻守”，而是和推进舱一样，在与返回舱分离的一刻坠入大气层。
此前，无论是“神六”还是“神五”，在航天员随返回舱回归之后，被分离的轨道舱仍会在轨运行半年左右的时间，期间将进行一些科学实验，并把有关实验数据持续传输到地面。在此之后，轨道舱因动力耗尽，会类似“太空垃圾”那样在太空中游荡，渐渐被地球引力拉回到地面坠下。
焦维新解释，“神七”的轨道舱之所以不再留在轨道，是因为研究人员将把“神七”的试验方向集中在保障航天员顺利出舱活动方面。
第四大不同：航天服要求适应太空行走要求
“神七”要执行的主要任务是实现我国首次太空行走。3名航天员一个要出舱行走，一个在轨道舱迎接，返回舱还要留人。“航天员进行太空行走的目的，是为了维修、装卸、更换和回收航天器及航天器的外部设备。”焦维新教授称。
“神七”将具备航天员太空行走的几项必备条件。舱外航天服必须具有防微流星、真空隔热屏蔽、气密、保压、通风、调温等多种功能。另外，舱外航天服的手套必须既密封又灵活，头盔也要既透明又密封。
焦维新教授介绍说，“航天服后背的位置会有一个背袋，里面除了氧气瓶、一些工具外，还会有一个燃料助推器，他的 主要作用是使航天员可以借此控制行走方向。为了不让航天员飘走，航天服上还有一个我们称作脐带的特制绳子，专门将航天员与轨道舱接在一起。”而且，“神 七”航天员的宇航服上还将配有一块特制的银蓄电池。当航天员进行舱外活动时，它就开始源源不断地输出能量，待电时间将比原来提高2到3倍。
第五大不同：航天员像开战斗机一样驾“神七”
“神六”在太空飞行期间，费俊龙和聂海胜两名航天员先后进行开关舱门、穿脱压力服、穿舱、抽取冷凝水四大项“在轨干扰力”实验。结果表明，航天员较大幅度动作对飞船姿态影响微小，飞船姿态保持良好。费俊龙甚至还在飞船上连续做了4个前滚翻。
据说，这是航天员自己在游戏，不是事先安排的。此次空间飞行结果表明，从刚升空到准备返回，费俊龙和聂海胜任何时间都能正确发出指令、准确控制各种设备，舱门开关等动作较大的操作也能一次成功。
专家介绍说，有了“神六”实验的基础，“神七”将安排航天员“像驾驶战斗机一样驾驶飞船”，这对于飞行员出身的中国航天员来说，简直是驾轻就熟的事情。
